此后,努尔哈赤继续使用这种恩威并施的政策,双方逐渐结盟。到1612年,努尔哈赤遣使往科尔沁部,提出聘女为妃,欲结为姻戚。明安遂将其女儿嫁与。1615年,努尔哈赤又纳科尔沁部贝勒孔果尔之女为妃。自此,清皇室与科尔沁部的蒙古封建主开始了联姻。这种关系从清朝开国之前一直延续下来,双方互相嫁娶不断。
首先是清朝皇帝娶科尔沁部的蒙古王公之女为后妃,这在清朝初年表现得最为明显。科尔沁部的莽古思、明安本是兄弟,在明安的女儿嫁给努尔哈赤后,1614年莽古斯又将女儿嫁给了努尔哈赤之子皇太极。此女后来就是孝端文皇后。到1625年,莽古思的儿子科尔沁部贝勒宰桑也将女儿嫁给了皇太极。此女初封为永福宫庄妃,后来成为孝庄文皇后。1634年,庄妃的姐姐也嫁给了皇太极,封为关睢宫宸妃。这就出现了明安、莽古思两兄弟将女儿分别嫁给了努尔哈赤、皇太极父子,孝端、孝庄、宸妃姑侄三人同嫁皇太极一夫的情况。这种婚嫁,尽管从今天的风俗看来这不合伦理,但是在当时的满蒙礼俗看来完全正常。到1651年,宰桑长子科尔沁部卓里克图亲王乌克善之女、孝庄文皇后的侄女,被清世祖福临封为皇后,后来降为静妃。1654年,宰桑之孙科尔沁部镇国公绰尔济,将两个女儿都嫁给了福临。姐姐被册为皇后,即孝惠章皇后;妹妹被封为妃,即淑惠妃。推算起来,这两姐妹都是孝庄文皇后的侄孙女了。清代蒙古族皇后共有六位,其中四位出自科尔沁部,即上述的孝端文皇后、孝庄文皇后、清世祖废后和孝惠章皇后。