圭山地区广泛分布着古代可溶性碳酸盐沉积岩、石灰岩发育形成的典型的岩溶地貌。奇峰、溶洞、落水漏斗遍布的地貌景观为其所特有。彩云壁、摩天岩在林海中时隐时现,其粉红色的、黑白相间的峭壁高数十丈,巍然耸立。
2、植被
圭山森林覆盖达80%,分布着多样的森林植被,多是受高原亚热带季风影响形成的半湿常绿阔叶林,主要是滇青冈、清香木、黄毛青冈和杜鹃等构成的群落植被。随着圭山地势的起伏,草坪也分成数台,颇具情趣。每到入春和盛夏时节,丰富的蕨类植物如三叶草、彩叶草、滇紫草、石槲、龙胆草等野花争相开放,灿烂纷呈,漫步在酥软如绿毯的草地上,幽香扑鼻顿觉心旷神怡。珍贵植物及天然药草遍及圭山每个角落,常见植物有460余种。国家二级保护植物有:红椿、云南樟木、三尖杉、榉木、厚朴、杜仲、扇蕨等;省二级保护植物有:小果南烛,裂果漆;省**保护植物有:滇香木、荼条木、十大功劳、刺黄莲等,还拥有云南人引以自豪的茶花,杜鹃和报春花三大名花,药草有草鸟、叶上花、天麻、三棵针、半夏、百合乌梅、龙胆草、桔梗等上百余种,这些珍稀和名贵的植物是全人类珍贵的自然资源,对于生物多样性的保护、遗传学、生态学、社会及经济发展等方面都有很高的价值。
圭山山高林密,森林生态环境良好,是野生动物的天然栖息场所,主要野生动物有:穿山甲、果子狸、麂子、鹰、八哥、山鸡、画眉、啄木鸟、白腹锦鸡、喜鹊、野兔、九节灵、松鼠、蜍及青竹标、绿蛇、蜥蜴等。
圭山东北部地势平缓,西南两面山体陡峻、峭壁嶙刚、森林险峰融为一体,山体浑圆高耸入云,站立山外从不同的角度看圭山,真乃"横看成岭侧成峰,远近高低各不同"。